ERROR 2006 (HY000) at line 12905: MySQL server has gone away

Para solucionar este problema, deberás de modificar el fichero /etc/my.cnf

En la etiqueta [mysqld] pon al final:

[mysqld]
innodb_buffer_pool_size=2048M
query_cache_size=300M
max_allowed_packet=512M

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Tan solo debes de modificar el archivo /etc/motd 

(24)Too many open files: AH02179: apr_socket_accept: (client socket)

Si su servicio apache no se inicia por este error: (24)Too many open files: AH02179:...